[SP-pm] Desenhando com perl

Andre Carneiro andregarciacarneiro at gmail.com
Tue Apr 27 13:08:17 PDT 2010


Esses são só exemplos de um 'howto'...

Dá uma olhada nos módulos que eu tenho certeza que você vai conseguir usar,
mesmo que seus dados não venham do BLAST.

Só tô querendo evitar re-invenção de roda desncessária...

Cheers!



2010/4/27 Ramon Vidal <ramon.vidal at gmail.com>

> Como não usar nada de blast, nem alinhamento, acho q o bioperl nao seria
> necessário. Até agora acho q o GD resolve fácil, vou dar uma olhada no
> gerador de gráficos do PDL também.
> Muito obrigado
>
> Ramon Vidal
>
> Laboratório de Genômica e Expressão - LGE
> Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP
>
>
>
>
> 2010/4/27 Nelson Ferraz <nferraz at gmail.com>
>
>> 2010/4/27 Ramon Vidal <ramon.vidal at gmail.com>:
>> > Só quero gerar imagens simples (polígonos) a partir de coordenadas
>> > conhecidas para representar uma sequencia de DNA e algumas estruturas.
>> Tipo
>> > a figura central (LTR, gag, polimerase, ...) dessa
>> > imagem: http://www.aphis.usda.gov/vs/cvb/lpd/sifs/fig2cat1&3.jpg
>> > Tenho um programa para identificar algumas regiões e queria mostrar
>> > graficamente onde essas regiões estão.
>>
>> O GraphViz pode ser útil:
>>
>> http://www.graphviz.org/
>>
>> Veja alguns exemplos aqui:
>>
>> http://www.graphviz.org/Gallery.php
>>
>> http://images.google.com/images?q=graphviz
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André Garcia Carneiro
Analista/Desenvolvedor Perl
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