[SP-pm] Desenhando com perl

Ramon Vidal ramon.vidal at gmail.com
Tue Apr 27 12:50:33 PDT 2010


Como não usar nada de blast, nem alinhamento, acho q o bioperl nao seria
necessário. Até agora acho q o GD resolve fácil, vou dar uma olhada no
gerador de gráficos do PDL também.
Muito obrigado

Ramon Vidal

Laboratório de Genômica e Expressão - LGE
Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP




2010/4/27 Nelson Ferraz <nferraz em gmail.com>

> 2010/4/27 Ramon Vidal <ramon.vidal em gmail.com>:
> > Só quero gerar imagens simples (polígonos) a partir de coordenadas
> > conhecidas para representar uma sequencia de DNA e algumas estruturas.
> Tipo
> > a figura central (LTR, gag, polimerase, ...) dessa
> > imagem: http://www.aphis.usda.gov/vs/cvb/lpd/sifs/fig2cat1&3.jpg
> > Tenho um programa para identificar algumas regiões e queria mostrar
> > graficamente onde essas regiões estão.
>
> O GraphViz pode ser útil:
>
> http://www.graphviz.org/
>
> Veja alguns exemplos aqui:
>
> http://www.graphviz.org/Gallery.php
>
> http://images.google.com/images?q=graphviz
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