[SP-pm] Boas Vindas ao Fabio Navarro

[Alexei Znamensky]

2010/3/5 Andre Carneiro <andregarciacarneiro em gmail.com>
[...]

> Nessas repetições de sequência, cada nucleotídeo (actg) tinha uma 'nota'. O
> Consed fazia uma relação entre repetições de nucleotídeos e as notas para
> montar uma sequência única no final. Como na metodologia 'shotgun' as
> sequências eram muito pequenas, sempre sobravam muitos 'gaps' para resolver.
> No meu tempo eu usava o BLAST, *capturando sequencias de DNA de diversos
> organismos para bater com a sequencia que eu já tinha, na esperança de obter
> as sequências faltantes*. Esse sistema usa um algoritmo chamado
> 'Smith-Waterman' para gerar as sobreposições da sequencia que eu enviaria a
> ele, com as sequencias que ele pega no GenBank,  e assim eu tinha vários
> resultados com várias notas também. Mas essa nota não era para cada
> nucleotídeo e sim para as sequencias que ele encontrou, ou se vc preferir, é
> uma nota de 'similaridade'.
>

Por acaso não era no Jurassic Park que você trabalhava?

-- 
Alexei Znamensky [russoz_gmail_com] [russoz.wordpress.com] [
www.flickr.com/photos/alexeiz]
"Though we live in trying times, we're the ones who have to try"
-------------- Pr�xima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://mail.pm.org/pipermail/saopaulo-pm/attachments/20100305/fe49b0ac/attachment.html>