<div class="gmail_quote">2010/3/5 Andre Carneiro <span dir="ltr"><<a href="mailto:andregarciacarneiro@gmail.com">andregarciacarneiro@gmail.com</a>></span><div>[...] </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div class="gmail_quote"><div>Nessas repetições de sequência, cada nucleotídeo (actg) tinha uma 'nota'. O Consed fazia uma relação entre repetições de nucleotídeos e as notas para montar uma sequência única no final. Como na metodologia 'shotgun' as sequências eram muito pequenas, sempre sobravam muitos 'gaps' para resolver. No meu tempo eu usava o BLAST, <b><font class="Apple-style-span" color="#FF0000">capturando sequencias de DNA de diversos organismos para bater com a sequencia que eu já tinha, na esperança de obter as sequências faltantes</font></b>. Esse sistema usa um algoritmo chamado 'Smith-Waterman' para gerar as sobreposições da sequencia que eu enviaria a ele, com as sequencias que ele pega no GenBank, e assim eu tinha vários resultados com várias notas também. Mas essa nota não era para cada nucleotídeo e sim para as sequencias que ele encontrou, ou se vc preferir, é uma nota de 'similaridade'. <br>
</div></div></blockquote><div><br></div><div>Por acaso não era no Jurassic Park que você trabalhava? </div><div><br></div></div>-- <br>Alexei Znamensky [russoz_gmail_com] [<a href="http://russoz.wordpress.com">russoz.wordpress.com</a>] [<a href="http://www.flickr.com/photos/alexeiz">www.flickr.com/photos/alexeiz</a>]<br>
"Though we live in trying times, we're the ones who have to try"<br>