[Rio-pm] Opinião

[Daniel Hughes]

pipelines sao usados o tempo todo em bioinformatica e podem ser sistemas bem
complicados que geram os processo intermediarios si mesmos. mas em realidade
a coisa mais importante eh a colecao de regras de inter-dependencia entre as
varias etapas. por este fato nunca sub-estime o velho 'make'. pode ser
utilisados pra prejotos bem complicados.

dan.


Daniel S. T. Hughes M.Biochem (Hons; Oxford), Ph.D (Cambridge)
European Bioinformatics Institute
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dsth em ebi.ac.uk
dsth em cantab.net


2011/9/3 André Torres <andretorresrj em gmail.com>

> Eu acho que é exatamente isso que eu preciso. um pipeline.
> eu preciso fazer com que a informação que cada software devolve seja
> avaliada por outro e que no final me devolva uma coisa arrumada. enfim, vou
> ter que estudar bastante isso antes de começar.
>
> aceito mais ideias se alguem tiver.
>
> valeu galera, vcs ajudaram bastante dando um rumo pra começar a pesquisar.
> abração.
>
> Em 2 de setembro de 2011 15:15, Eden Cardim <edencardim em gmail.com>escreveu:
>
> >>>>> "André" == André Torres <andretorresrj em gmail.com> writes:
>>
>>    André> dou o input para o primeiro software e recebo o output o
>>    André> output do primeiro vai ser aberto no segundo software que por
>>    André> sua vez vai me dar outro output.  haveria a possbilidade de
>>    André> fazer o segundo software entender que os outputs do primeiro
>>    André> ja estariam prontos para serem abertos por ele e
>>    André> "analisados"?
>>
>> Isso se chama "pipeline", o mundo unix costuma abreviar para "pipe". Se
>> você estiver num unix, isso já tá implementado pra você
>> genericamente. Se você quiser algo mais específico e programático, tem
>> protocolos/softwares para gestão de filas como o AMPQ.
>>
>> --
>>  Eden Cardim
>>  Code Monkey                    http://www.shadowcat.co.uk/catalyst/
>>  Shadowcat Systems Ltd.  Want a managed development or deployment
>> platform?
>> http://blog.edencardim.com/
>> http://www.shadowcat.co.uk/servers/
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> André Torres
>
> "Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja
> animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante."
> (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952)
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