pipelines sao usados o tempo todo em bioinformatica e podem ser sistemas bem complicados que geram os processo intermediarios si mesmos. mas em realidade a coisa mais importante eh a colecao de regras de inter-dependencia entre as varias etapas. por este fato nunca sub-estime o velho 'make'. pode ser utilisados pra prejotos bem complicados.<div>
<br></div><div>dan.<br><div><br></div><div><br clear="all">Daniel S. T. Hughes M.Biochem (Hons; Oxford), Ph.D (Cambridge)<br>European Bioinformatics Institute</div><div>-------------------------------------------------------------------------------------<br>
<a href="mailto:dsth@ebi.ac.uk">dsth@ebi.ac.uk</a></div><div><a href="mailto:dsth@cantab.net">dsth@cantab.net</a><br><br><br><div class="gmail_quote">2011/9/3 André Torres <span dir="ltr"><<a href="mailto:andretorresrj@gmail.com">andretorresrj@gmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div>Eu acho que é exatamente isso que eu preciso. um pipeline.</div><div>eu preciso fazer com que a informação que cada software devolve seja avaliada por outro e que no final me devolva uma coisa arrumada. enfim, vou ter que estudar bastante isso antes de começar.</div>
<div> </div><div>aceito mais ideias se alguem tiver.</div><div> </div><div>valeu galera, vcs ajudaram bastante dando um rumo pra começar a pesquisar.</div><div>abração.<br><br></div><div class="gmail_quote">Em 2 de setembro de 2011 15:15, Eden Cardim <span dir="ltr"><<a href="mailto:edencardim@gmail.com" target="_blank">edencardim@gmail.com</a>></span> escreveu:<div>
<div></div><div class="h5"><br>
<blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;padding-left:1ex;border-left-color:rgb(204, 204, 204);border-left-width:1px;border-left-style:solid" class="gmail_quote">>>>>> "André" == André Torres <<a href="mailto:andretorresrj@gmail.com" target="_blank">andretorresrj@gmail.com</a>> writes:<br>
<br>
André> dou o input para o primeiro software e recebo o output o<br>
André> output do primeiro vai ser aberto no segundo software que por<br>
André> sua vez vai me dar outro output. haveria a possbilidade de<br>
André> fazer o segundo software entender que os outputs do primeiro<br>
André> ja estariam prontos para serem abertos por ele e<br>
André> "analisados"?<br>
<br>
Isso se chama "pipeline", o mundo unix costuma abreviar para "pipe". Se<br>
você estiver num unix, isso já tá implementado pra você<br>
genericamente. Se você quiser algo mais específico e programático, tem<br>
protocolos/softwares para gestão de filas como o AMPQ.<br>
<font color="#888888"><br>
--<br>
Eden Cardim<br>
Code Monkey <a href="http://www.shadowcat.co.uk/catalyst/" target="_blank">http://www.shadowcat.co.uk/catalyst/</a><br>
Shadowcat Systems Ltd. Want a managed development or deployment platform?<br>
<a href="http://blog.edencardim.com/" target="_blank">http://blog.edencardim.com/</a> <a href="http://www.shadowcat.co.uk/servers/" target="_blank">http://www.shadowcat.co.uk/servers/</a><br>
<a href="http://twitter.com/#!/edenc" target="_blank">http://twitter.com/#!/edenc</a><br>
</font><div><div></div><div>_______________________________________________<br>
Rio-pm mailing list<br>
<a href="mailto:Rio-pm@pm.org" target="_blank">Rio-pm@pm.org</a><br>
<a href="http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm" target="_blank">http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm</a><br>
</div></div></blockquote></div></div></div><br><br clear="all"><div><div></div><div class="h5"><br>-- <br>André Torres<br><br>"Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante." (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952)<br>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
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<a href="mailto:Rio-pm@pm.org">Rio-pm@pm.org</a><br>
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