[SP-pm] Perl no X-meeting 2010

[Lindolfo "Lorn" Rodrigues]

Parabéns Wagner, eu não conheço nada de bioinformatica só sei que existe um
namespace no cpan para isso:

http://search.cpan.org/search?query=bio&mode=all

Mas isso você já devia saber, você conhece o material que o otaviof e o
maluco usou no curso da FEI?
https://github.com/otaviof/SPPM-Perl_101

E tem o livro que o Solli começou a traduzir:
https://github.com/shonorio/beginning-perl

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3) ainda dentro da minha percepção, essas pessoas com esse perfil
descrevi acima, querem/precisam aprender Perl e no ambiente acadêmico
onde se encontram não existem muitas oportunidades de aprendizado de
Perl. Entretanto, cabe uma ressalva: essas pessoas querem Perl
aplicado aos seu problemas e não aprender uma linguagem de
programação.

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Não existe um framework Perl para isso?
http://search.cpan.org/~cjfields/BioPerl-1.6.1/BioPerl.pm
Pelo pouco que olhei na pagina do tutorial, o conhecimento de Perl para usar
ele você aprenderia bem rapido, o foco é mais nos problemas de
bioinformatica.


2010/11/22 Wagner Arbex <arbex em arbex.pro.br>

> PessoALL;
>
> Não sei se vcs estão lembrados, mas há alguns meses tivemos uma
> discussão sobre a possibildiade de incluirmos uma trilha específica de
> aplicações em Perl para bioinformática no X-meeting 2010
> (http://lgmb.fmrp.usp.br/ab3c/xmeeting/2010/home), o que acabou não
> saindo. Mas, em virtude dessa mesma discussão, tb não sei se vcs se
> lembram, acabou saindo um curso introdutório de Perl, específico para
> bioinformática, no qual fui o instrutor.
>
> Assim, quero apenas passar algumas poucas informações a respeito do
> mesmo e espero que alguns colegas que estiveram presentes no evento
> complementem as minhas observações, visto que as minhas são
> "comprometidas", pois, como disse, eu fui o instrutor:
>
> 1) o curso teve uma procura muito grande e mais de 40 pessoas se
> inscreveram. O que causou uma boa supresa na organização do evento e,
> além disso, a frequência sempre esteve próxima do 90% dos inscritos. A
> frequência tb causou uma boa surpresa, pois o se iniciou as 8h nos 3
> dias... bom, quem já esteve em um congresso, conferência etc. sabe que
> as noites são de festa e, então, assistir aulas as 8h não é nada fácil
> :)
>
> 2) recebi um retorno MUITO positivo sobre a
> necessidade/desejo/possibilidade do uso de Perl em bioinformática e
> biologia computacional. Para a maioria de nós, isso não é novidade,
> mas o público do curso era formado em sua GRANDE maioria de
> pós-graduandos das áreas de biologia, bioquímica entre outras e
> ninguém, ou quase ninguém, possuia qq formação em computação. Ou seja,
> para muitos dos que fizeram o curso, Perl foi uma descoberta;
>
> 3) ainda dentro da minha percepção, essas pessoas com esse perfil
> descrevi acima, querem/precisam aprender Perl e no ambiente acadêmico
> onde se encontram não existem muitas oportunidades de aprendizado de
> Perl. Entretanto, cabe uma ressalva: essas pessoas querem Perl
> aplicado aos seu problemas e não aprender uma linguagem de
> programação.
>
> Com relação ao X-meeting 2011, que será em setembro de 2011, em
> Florianópolis, creio que podemos retomar a idéia de apresentarmos
> trabalhos, ferramentas de Perl aplicado a bioinformática e biologia
> computacional. Não sei se conseguiremos uma trilha específica par tal
> - na verdade, nem sei se é necessária -  mas, p ex, esse ano existia a
> trilha de banco de dados e ferramentas de bioinformática, onde
> trabalhos em Perl seriam muito bem vindos.
>
> De qq forma, para que seja possível a comunidade Perl "fazer bonito"
> em um conferência como essa, temos que nos organizar, principalmente,
> a galera que trabalha com computação científica para conseguirmos um
> bom número de trabalhos e trabalhos de qualidade.
>
> Ok... abri uma discussão e deixei meus dois cents.
>
> []s e até mais.
> Arbex
>
> --
>    Wagner Arbex
>    http://www.arbex.pro.br/
> _______________________________________________
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> SaoPaulo-pm em pm.org
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