Parabéns Wagner, eu não conheço nada de bioinformatica só sei que existe um namespace no cpan para isso:<br><br><a href="http://search.cpan.org/search?query=bio&mode=all">http://search.cpan.org/search?query=bio&mode=all</a><br>
<br>Mas isso você já devia saber, você conhece o material que o otaviof e o maluco usou no curso da FEI?<br><a href="https://github.com/otaviof/SPPM-Perl_101">https://github.com/otaviof/SPPM-Perl_101</a><br><br>E tem o livro que o Solli começou a traduzir:<br>
<a href="https://github.com/shonorio/beginning-perl">https://github.com/shonorio/beginning-perl</a><br><br>--------<br><br>3) ainda dentro da minha percepção, essas pessoas com esse perfil<br>
descrevi acima, querem/precisam aprender Perl e no ambiente acadêmico<br>
onde se encontram não existem muitas oportunidades de aprendizado de<br>
Perl. Entretanto, cabe uma ressalva: essas pessoas querem Perl<br>
aplicado aos seu problemas e não aprender uma linguagem de<br>
programação.<br><br>-----<br><br>Não existe um framework Perl para isso? <a href="http://search.cpan.org/~cjfields/BioPerl-1.6.1/BioPerl.pm">http://search.cpan.org/~cjfields/BioPerl-1.6.1/BioPerl.pm</a><br>Pelo pouco que olhei na pagina do tutorial, o conhecimento de Perl para usar ele você aprenderia bem rapido, o foco é mais nos problemas de bioinformatica.<br>
<br><br><div class="gmail_quote">2010/11/22 Wagner Arbex <span dir="ltr"><<a href="mailto:arbex@arbex.pro.br">arbex@arbex.pro.br</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
PessoALL;<br>
<br>
Não sei se vcs estão lembrados, mas há alguns meses tivemos uma<br>
discussão sobre a possibildiade de incluirmos uma trilha específica de<br>
aplicações em Perl para bioinformática no X-meeting 2010<br>
(<a href="http://lgmb.fmrp.usp.br/ab3c/xmeeting/2010/home" target="_blank">http://lgmb.fmrp.usp.br/ab3c/xmeeting/2010/home</a>), o que acabou não<br>
saindo. Mas, em virtude dessa mesma discussão, tb não sei se vcs se<br>
lembram, acabou saindo um curso introdutório de Perl, específico para<br>
bioinformática, no qual fui o instrutor.<br>
<br>
Assim, quero apenas passar algumas poucas informações a respeito do<br>
mesmo e espero que alguns colegas que estiveram presentes no evento<br>
complementem as minhas observações, visto que as minhas são<br>
"comprometidas", pois, como disse, eu fui o instrutor:<br>
<br>
1) o curso teve uma procura muito grande e mais de 40 pessoas se<br>
inscreveram. O que causou uma boa supresa na organização do evento e,<br>
além disso, a frequência sempre esteve próxima do 90% dos inscritos. A<br>
frequência tb causou uma boa surpresa, pois o se iniciou as 8h nos 3<br>
dias... bom, quem já esteve em um congresso, conferência etc. sabe que<br>
as noites são de festa e, então, assistir aulas as 8h não é nada fácil<br>
:)<br>
<br>
2) recebi um retorno MUITO positivo sobre a<br>
necessidade/desejo/possibilidade do uso de Perl em bioinformática e<br>
biologia computacional. Para a maioria de nós, isso não é novidade,<br>
mas o público do curso era formado em sua GRANDE maioria de<br>
pós-graduandos das áreas de biologia, bioquímica entre outras e<br>
ninguém, ou quase ninguém, possuia qq formação em computação. Ou seja,<br>
para muitos dos que fizeram o curso, Perl foi uma descoberta;<br>
<br>
3) ainda dentro da minha percepção, essas pessoas com esse perfil<br>
descrevi acima, querem/precisam aprender Perl e no ambiente acadêmico<br>
onde se encontram não existem muitas oportunidades de aprendizado de<br>
Perl. Entretanto, cabe uma ressalva: essas pessoas querem Perl<br>
aplicado aos seu problemas e não aprender uma linguagem de<br>
programação.<br>
<br>
Com relação ao X-meeting 2011, que será em setembro de 2011, em<br>
Florianópolis, creio que podemos retomar a idéia de apresentarmos<br>
trabalhos, ferramentas de Perl aplicado a bioinformática e biologia<br>
computacional. Não sei se conseguiremos uma trilha específica par tal<br>
- na verdade, nem sei se é necessária - mas, p ex, esse ano existia a<br>
trilha de banco de dados e ferramentas de bioinformática, onde<br>
trabalhos em Perl seriam muito bem vindos.<br>
<br>
De qq forma, para que seja possível a comunidade Perl "fazer bonito"<br>
em um conferência como essa, temos que nos organizar, principalmente,<br>
a galera que trabalha com computação científica para conseguirmos um<br>
bom número de trabalhos e trabalhos de qualidade.<br>
<br>
Ok... abri uma discussão e deixei meus dois cents.<br>
<br>
[]s e até mais.<br>
Arbex<br>
<font color="#888888"><br>
--<br>
Wagner Arbex<br>
<a href="http://www.arbex.pro.br/" target="_blank">http://www.arbex.pro.br/</a><br>
_______________________________________________<br>
SaoPaulo-pm mailing list<br>
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