[SP-pm] Perl and Bioinformatics

[Ramon Vidal]

Sm, o Bioperl é bastante abrangente, tem biblioteca pra qq coisa em bio, e
tem parser para outputs de qq programa também.
Vc tem razão, eu acho q nao conheço nem metade do que o bioperl pode fazer
por mim, deveria ter uma apresentação sobre ele... Será q o Jason topa? rsrs

Ramon Vidal

Laboratório de Genômica e Expressão - LGE
Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP




2010/3/28 Andre Carneiro <andregarciacarneiro em gmail.com>

> Não sei se já foi feito, mas quando eu lidava com isso, acabei descobrindo
> Bioperl sozinho... Será que ainda hoje é assim? Bioperl é bastante
> abrangente no sentido de que a maior parte das áreas que envolvem
> bioinoformática tem algum módulo para resolver problemas relacionados(Embora
> eu não tenha usado tanto assim).
>
> Indo ao ponto, não seria legal ter uma apresentação de Bioperl no evento?
> Apresentando as facilidades, recursos, 'black magic of perl' usando Bioperl,
> etc???
>
>
>
>
> Cheers!
>
> 2010/3/26 Ramon Vidal <ramon.vidal em gmail.com>
>
>> Acho q ambos seriam interessantes... É so apresentar um PBP softcore, se é
>> q existe isso. Existem bioinformatas que se dedicam no desenvolvimento mais
>> aprimorado e aqueles que querem o resultado para ontem (o que realmente é a
>> maioria). Então tem público de todo o tipo
>>
>>
>>
>> Ramon Vidal
>>
>> Laboratório de Genômica e Expressão - LGE
>> Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP
>>
>>
>>
>>
>> 2010/3/26 Solli Honorio <shonorio em gmail.com>
>>
>>> Ok Eden, então vou só para pagar a primeira rodada e entregar os crachas
>>> :D, vc fala de PDL :D
>>>
>>> Solli M. Honório
>>>
>>> Em 26 de março de 2010 17:12, Eden Cardim <edencardim em gmail.com>escreveu:
>>>
>>> 2010/3/26 Solli Honorio <shonorio em gmail.com>:
>>>> > Wagner,
>>>> >
>>>> > O meu 'apoio' + 5 reais paga o café na esquina, então vou fazer o
>>>> seguinte,
>>>> > vou pagar a 1o. rodada de cerveja no evento, como contribuição. Por
>>>> favor,
>>>> > toque o barco.
>>>> >
>>>> > Precisamos saber que tipo de palestra seria interessante para um
>>>> evento
>>>> > deste. Eu, por exemplo, não conheço nada de Bio, mas poderia fazer uma
>>>> > palestra relacionada ao PBP (Perl Best Practice).
>>>>
>>>> Não sei se PBP seria atrativo pra esse tipo de público, pela minha
>>>> parca experiência, bioinformatas tendem a preferir coisas que possam
>>>> ser aplicados imediatamente para obter resultados. Por exemplo, andei
>>>> dando uma olhada no PDL durante minha internação e acho que isso seria
>>>> algo mais interessante para um bioinformata do que a meta-informação
>>>> do PBP.
>>>>
>>>> --
>>>>   Eden Cardim       Need help with your Catalyst or DBIx::Class project?
>>>>  Code Monkey                    http://www.shadowcat.co.uk/catalyst/
>>>>  Shadowcat Systems Ltd.  Want a managed development or deployment
>>>> platform?
>>>> http://edenc.vox.com/            http://www.shadowcat.co.uk/servers/
>>>> _______________________________________________
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