[Moscow.pm] "Perl -- за и против"
Grigory V.Sapunov
grigory.sapunov на gmail.com
Сб Сен 1 06:28:30 PDT 2012
>
>
>> А ваши сомнения на чём основаны?
>>
>
> Основаны на том, что для расшифровки RNA написано очень много кода на Perl
> (не только известный bioperl)
> и подавляющее большинство иностранных Web-ресурсов (например, NCBI)
> использует perl-scripts.
>
С тем количеством проектов, которое есть в ncbi, я думаю, там вообще много
всего можно найти :)
> Думаю, выбор perl здесь не случаен --- основан на особенностях языка,
> оптимизированного
> для работы с последовательностями символов (RNAseq, proteins, ...)
>
Это, конечно, да, но хардкорный анализ (типа различных бластов) чаще
реализуется на чём-то более эффективном, типа C. blast+, например, на
плюсах.
Мне кажется, перл здесь больше годится для всякой мелкой работы. Как клей.
----------- следущая часть -----------
Вложение в формате HTML было извлечено…
URL: <http://mail.pm.org/pipermail/moscow-pm/attachments/20120901/b8f677d1/attachment.html>
Подробная информация о списке рассылки Moscow-pm