[SP-pm] ordenando arquivos.

Bruno Buss bruno.buss at gmail.com
Thu Jul 28 13:19:56 PDT 2011


2011/7/28 Thiago Yukio Kikuchi Oliveira <stratust at gmail.com>

> Esse arquivo de alinhamento não é ordenado. Uma das primeiras análises que
> fazemos nesse arquivo de alinhamento é descobrir a cobertura do
> sequenciamento (quantas sequencias cobrem a mesma região). E para fazer isso
> é necessário ter as coordenadas genômicas ordenadas.
>

Só de curiosidade, como vocês fazem a contagem de overlaps após terem as
sequências ordenadas?
(Eu não trabalho nem nunca estudei isso em específico, então desculpa se for
uma pergunta besta :)

[ ]'s
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Bruno C. Buss
http://brunobuss.wordpress.com/
http://www.dcc.ufrj.br/~brunobuss/
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