[SP-pm] Boas Vindas ao Fabio Navarro

[Alexei Znamensky]

2010/3/5 Fábio C. P. Navarro <fabiocpn em gmail.com>

> Nelson,
>
> Formalmente perl não é utilizado nas matérias do currículo. Os professores
> dão maior enfase em C,C++ e Java, (passando por algumas linguagens
> funcionais e lógicas). Porém não sei te dizer se alguma disciplina opcional
> usa perl como linguagem de programação. Posso estar enganado, mas acredito
> que nenhum professor seja especialista em perl.
>

Pois é, estamos tentando mudar isso, mas é um processo bem lento. E
doloroso. :-)


> Quanto aos meus projetos atuais, trabalhamos com sequenciamento de DNA e
> RNA de linhagens e tecidos celulares normais e tumorais. Mais
> especificamente, sob uma perspetiva mais bioinformata, o que fazemos é
> processar uma quantidade grande de dados (na casa de centenas de gigas)
> procurando por caracteristicas desejadas. Perl me parece ser uma boa escolha
> nestes casos pelas facilidades de uso de regex e pelas suas estruturas de
> dados (hashes são uma ao na roda!).
>

Fábio, fiquei curioso: as sequências de DNA são armazenadas como um arquivo
texto, simples? Daí é só rodar uma regex em cima? Ou são usados arquivos DB,
gdbm ou algum outro tipo de armazenamento mais específico para esse tipo de
sistema?

[]s,
Russo

-- 
Alexei Znamensky [russoz_gmail_com] [russoz.wordpress.com] [
www.flickr.com/photos/alexeiz]
"Though we live in trying times, we're the ones who have to try"
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