[Cascavel-pm] perl, MySQL e bio informatica

[Vanderson Sampaio]

Olá Artur,
Eu trabalho com bioinfo faz um tempo já, já usei muito perl pra tratamento
de arquivos e geração de relatórios. Cheguei a desenvolver duas aplicações
(uma Desktop - com perl-Tk e uma web - perl+DBI+CGI) para basecalling,
limpeza de vetores e contaminantes, montagem e anotação de genomas
(mitocondriais). Se você quiser mais detalhes ou algum código, envie um
email pra mim que eu posso procurar alguma coisa por aqui e te retorno.
A ferramenta desktop era o MitoGen 1.0 e o seu equivalente pra web se
chamava WMitoGen (incrível não?). Publiquei no SBG de uns 2 anos atrás eu
acho. Se quiser procurar por lá pelos resumos vc encontra...
Além disso, publiquei junto com uns amigos um artiguinho bacana pra revista
biotecnologia. Chama "Bioinformática: Manual do Usuário"... procura em
www.biotecnologia.com.br <http://www.biotecnologia.com.br>

[]'s


Em 17/11/05, Arthur Felipe Steiner <afs18 em yahoo.com> escreveu:
>
> Pessoal,
> faço iniciação cientifica, e meu projeto é o
> desenvolvimento de um banco de dados em MySQL on-line
> para organizar os dados coletados no laboratório de
> genetica animal aqui da faculdade. Uso Perl para fazer
> as paginas dinamicas, ultilizando o modulo CGI e DBI
> para interagir com o banco de dados.
> Eu tenho que escrever um relatorio até o fim do ano
> para o CNPq e gostaria de citar projetos semelhantes
> ao meu. Se alguem ai souber de alguma coisa por favor
> me ajudem!
> Obrigado
> Arthur
>
>
>
>
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Vanderson Sampaio
Biólogo - Especialista em Bioinformática
Mestre em Genética e Biol. Molecular
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