eheheh !Mais ou menos. Aquela época foi o meu primeiro contato com Perl. Tava perdidinho... uahuahauahauah!!!! Eu fui descobrir Bio::Perl e outras coisinhas depois de um tempo. Mas o processo 'puro' era isso aí mesmo... <br>
<br><div class="gmail_quote">2010/3/5 Alexei Znamensky <span dir="ltr"><<a href="mailto:russoz@gmail.com">russoz@gmail.com</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div class="gmail_quote">2010/3/5 Andre Carneiro <span dir="ltr"><<a href="mailto:andregarciacarneiro@gmail.com" target="_blank">andregarciacarneiro@gmail.com</a>></span><div>[...] </div><div class="im"><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div class="gmail_quote"><div>Nessas repetições de sequência, cada nucleotídeo (actg) tinha uma 'nota'. O Consed fazia uma relação entre repetições de nucleotídeos e as notas para montar uma sequência única no final. Como na metodologia 'shotgun' as sequências eram muito pequenas, sempre sobravam muitos 'gaps' para resolver. No meu tempo eu usava o BLAST, <b><font color="#ff0000">capturando sequencias de DNA de diversos organismos para bater com a sequencia que eu já tinha, na esperança de obter as sequências faltantes</font></b>. Esse sistema usa um algoritmo chamado 'Smith-Waterman' para gerar as sobreposições da sequencia que eu enviaria a ele, com as sequencias que ele pega no GenBank, e assim eu tinha vários resultados com várias notas também. Mas essa nota não era para cada nucleotídeo e sim para as sequencias que ele encontrou, ou se vc preferir, é uma nota de 'similaridade'. <br>
</div></div></blockquote><div><br></div></div><div>Por acaso não era no Jurassic Park que você trabalhava? </div><div><br></div></div><div><div></div><div class="h5">-- <br>Alexei Znamensky [russoz_gmail_com] [<a href="http://russoz.wordpress.com" target="_blank">russoz.wordpress.com</a>] [<a href="http://www.flickr.com/photos/alexeiz" target="_blank">www.flickr.com/photos/alexeiz</a>]<br>
"Though we live in trying times, we're the ones who have to try"<br>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
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(11)82907780<br>