<br><br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div class="Ih2E3d"><br>
</div>Não, eu não uso BioPerl... já andei olhando, mas achei que Perl "puro",<br>
seria mais robusto para o que eu precisava fazer. Entretanto, decidi<br>
mais por "achismo" do que por fundamentação.<br>
<div class="Ih2E3d"></div></blockquote><div class="Ih2E3d"><br>É que realmente Bioperl tem muita coisa pronta, inclusive tem uma interface legal com o BLAST(imagino que você deva usar bastante), e já tem muitas classes que representam coisas úteis como formatos de arquivo FASTA(e vários outros formatos que já não me lembro mais...rsrs), por exemplo. Fica bem fácil de processar. Além disso tem umas ferramentas gráficas que eu cheguei a usar bem pouco, mas que são bem úteis para produzir mapas de genes, com um montão de recursos. Vale a pena dar uma olhada. <br>
<br>
</div><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">O que mais se faz é tratamento de cadeia de caracteres... óbvio :D mas,<br>
para dar alguns exemplos práticos: busca de padrões ou de similaridades<br>
entre seqüências, identificação de diferenças entre seqüências,<br>
varreduras ou complementações de seqüências etc.<br>
<br>
[]s<br>
</blockquote><div><br><br>É... o saudade disso!! Espero poder voltar a mexer com isso um dia...<br> </div><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<br>
><br>
><br>
<font color="#888888"><br>
--<br>
</font><div><div></div><div class="Wj3C7c"> Wagner Arbex<br>
Doutorando em Engenharia de Sistemas e Computacao - COPPE/UFRJ<br>
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_______________________________________________<br>
SaoPaulo-pm mailing list<br>
<a href="mailto:SaoPaulo-pm@pm.org">SaoPaulo-pm@pm.org</a><br>
<a href="http://mail.pm.org/mailman/listinfo/saopaulo-pm" target="_blank">http://mail.pm.org/mailman/listinfo/saopaulo-pm</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>André Garcia Carneiro<br>Analista/Desenvolvedor Perl<br><br>