<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
FONT-SIZE: 10pt;
FONT-FAMILY:Tahoma
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Obrigado pelas dicas! Vou tentar esses outros editores de texto.<br><br>Abraços,<br>Alexandre<br><br><br><hr>Date: Tue, 22 Jul 2008 17:16:57 -0300<br>From: anderson.andis@gmail.com<br>To: saopaulo-pm@mail.pm.org<br>Subject: Re: [SP-pm] Res: Ajuda básica<br><br><div dir="ltr">Alexandre,<br><br>Saudações bio-perl !!!<br><br>Também trabalho com bioinformática.<br><br>Aliás, sugiro também o ConText (<a href="http://www.contexteditor.org/downloads.html" target="_blank">http://www.contexteditor.org/downloads.html</a>) como editor Perl que é super leve (1,6 Mb a última versão) e faz um ótimo highlight da sintax Perl.<br>
<br><br>Abraços,<br><br>-- <br>Anderson Martins<br><br><br><br><div class="EC_gmail_quote">2008/7/22 Márcio Vitor <<a href="mailto:cromo.jml@gmail.com">cromo.jml@gmail.com</a>>:<br><blockquote class="EC_gmail_quote" style="padding-left: 1ex;">
E por que não usar um editor ao invés do Notepad ?<br>
Neste link do Perl Monks rola uma discussão sobre o assunto:<br>
<a href="http://www.perlmonks.org/index.pl?node_id=43057" target="_blank">http://www.perlmonks.org/index.pl?node_id=43057</a><br>
Para Win já usei e gostei do TextPad e Gvim, mas editor é questão de<br>
gosto e necessidade, então só experimentando.<br>
Bem vindo!<br>
<br>
Márcio Vitor<br>
<br>
2008/7/22 Alexandre Tashima <<a href="mailto:aktashi@hotmail.com">aktashi@hotmail.com</a>>:<br>
<div><div></div><div class="EC_Wj3C7c">> Obrigado pelas respostas. Este erro do ; eu nem havia notado, porque eu<br>
> copiei novamente os arquivos do exemplo do livro.<br>
><br>
> Abraços,<br>
> Alexandre<br>
><br>
> ________________________________<br>
> Date: Tue, 22 Jul 2008 12:55:18 -0700<br>
> From: <a href="mailto:ricardo_filipo@yahoo.com.br">ricardo_filipo@yahoo.com.br</a><br>
> To: <a href="mailto:saopaulo-pm@mail.pm.org">saopaulo-pm@mail.pm.org</a><br>
> Subject: [SP-pm] Res: Ajuda básica<br>
><br>
> Paree que falta o ";" depois de<br>
><br>
> $proteinfilename = 'NM_021964fragment.pep'<br>
><br>
> E bons trabalhos com perl!<br>
> Abração!<br>
><br>
> ----- Mensagem original ----<br>
> De: Alexandre Tashima <<a href="mailto:aktashi@hotmail.com">aktashi@hotmail.com</a>><br>
> Para: <a href="mailto:saopaulo-pm@pm.org">saopaulo-pm@pm.org</a><br>
> Enviadas: Terça-feira, 22 de Julho de 2008 16:39:27<br>
> Assunto: [SP-pm] Ajuda básica<br>
><br>
> Olá,<br>
><br>
> Acabo de me inscrever na lista porque tenho algumas dúvidas básicas sobre<br>
> Perl. Estou começando a aprender a linguagem porque tenho interesse em<br>
> bioinformática e Perl me pareceu muito interessante para a área. Bom, estou<br>
> com uma dúvida básica e não sei se este é o meio adequado para resolvê-la,<br>
> mas vamos lá. Comecei a fazer alguns programas e usando o comando open para<br>
> abrir um arquivo, me aparece a seguinte mensagem de erro:<br>
><br>
><br>
> syntax error at read_prot.pl line 12, near "open"<br>
> Execution of read_prot.pl aborted due to compilation errors.<br>
><br>
><br>
> O programa que escrevi é do exemplo 4.5 do livro Beginning Perl for<br>
> Bioinformatics:<br>
><br>
> #!usr;bin;perl -w<br>
> # Reading protein sequence data from a file<br>
><br>
> # The filename of the file containing the protein sequence data<br>
><br>
> $proteinfilename = 'NM_021964fragment.pep'<br>
><br>
> # First, we have to open the file and associate<br>
> # a filehandle to it. We choose filehandle<br>
> # PROTEINFILE for readability.<br>
><br>
> open PROTEINFILE, $proteinfilename or die $!;<br>
><br>
> # Now we do the actual reading of the protein sequence data<br>
> # from the file by using the angle brackets <> to get the input<br>
> # from the filehandle. We store our data into our variable $protein<br>
><br>
> $protein = <PROTEIN>;<br>
><br>
> # Now that we've got our data, we can close the file<br>
><br>
> close PROTEIN;<br>
><br>
> # Print the DNA onto the screen<br>
><br>
> print "Here is the protein:\n\n";<br>
> print $protein, "\n\n";<br>
><br>
> exit;<br>
><br>
><br>
> e o arquivo 'NM_021964fragment.pep' contém uma sequência com letras de<br>
> aminoácidos que compõem uma proteína. Uso um computador IBM pentium 4 com<br>
> Windows XP Home. Não sei o que há de errado, alguém pode me ajudar a<br>
> resolver este problema?<br>
><br>
> Obrigado,<br>
> Alexandre<br>
><br>
><br>
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