[SP-pm] Res: Ajuda básica

[Anderson Martins]

Alexandre,

Saudações bio-perl !!!

Também trabalho com bioinformática.

Aliás, sugiro também o ConText (http://www.contexteditor.org/downloads.html)
como editor Perl que é super leve (1,6 Mb a última versão) e faz um ótimo
highlight da sintax Perl.


Abraços,

-- 
Anderson Martins



2008/7/22 Márcio Vitor <cromo.jml em gmail.com>:

> E por que não usar um editor ao invés do Notepad ?
> Neste link do Perl Monks rola uma discussão sobre o assunto:
> http://www.perlmonks.org/index.pl?node_id=43057
> Para Win já usei e gostei do TextPad e Gvim, mas editor é questão de
> gosto e necessidade, então só experimentando.
> Bem vindo!
>
> Márcio Vitor
>
> 2008/7/22 Alexandre Tashima <aktashi em hotmail.com>:
> > Obrigado pelas respostas. Este erro do ; eu nem havia notado, porque eu
> > copiei novamente os arquivos do exemplo do livro.
> >
> > Abraços,
> > Alexandre
> >
> > ________________________________
> > Date: Tue, 22 Jul 2008 12:55:18 -0700
> > From: ricardo_filipo em yahoo.com.br
> > To: saopaulo-pm em mail.pm.org
> > Subject: [SP-pm] Res: Ajuda básica
> >
> > Paree que falta o ";"  depois de
> >
> > $proteinfilename = 'NM_021964fragment.pep'
> >
> > E bons trabalhos com perl!
> > Abração!
> >
> > ----- Mensagem original ----
> > De: Alexandre Tashima <aktashi em hotmail.com>
> > Para: saopaulo-pm em pm.org
> > Enviadas: Terça-feira, 22 de Julho de 2008 16:39:27
> > Assunto: [SP-pm] Ajuda básica
> >
> > Olá,
> >
> > Acabo de me inscrever na lista porque tenho algumas dúvidas básicas sobre
> > Perl. Estou começando a aprender a linguagem porque tenho interesse em
> > bioinformática e Perl me pareceu muito interessante para a área. Bom,
> estou
> > com uma dúvida básica e não sei se este é o meio adequado para
> resolvê-la,
> > mas vamos lá. Comecei a fazer alguns programas e usando o comando open
> para
> > abrir um arquivo, me aparece a seguinte mensagem de erro:
> >
> >
> > syntax error at read_prot.pl line 12, near "open"
> > Execution of read_prot.pl aborted due to compilation errors.
> >
> >
> > O programa que escrevi é do exemplo 4.5 do livro Beginning Perl for
> > Bioinformatics:
> >
> > #!usr;bin;perl -w
> > # Reading protein sequence data from a file
> >
> > # The filename of the file containing the protein sequence data
> >
> > $proteinfilename = 'NM_021964fragment.pep'
> >
> > # First, we have to open the file and associate
> > # a filehandle to it. We choose filehandle
> > # PROTEINFILE for readability.
> >
> > open PROTEINFILE, $proteinfilename or die $!;
> >
> > # Now we do the actual reading of the protein sequence data
> > # from the file by using the angle brackets <> to get the input
> > # from the filehandle. We store our data into our variable $protein
> >
> > $protein = <PROTEIN>;
> >
> > # Now that we've got our data, we can close the file
> >
> > close PROTEIN;
> >
> > # Print the DNA onto the screen
> >
> > print "Here is the protein:\n\n";
> > print $protein, "\n\n";
> >
> > exit;
> >
> >
> > e o arquivo 'NM_021964fragment.pep' contém uma sequência com letras de
> > aminoácidos que compõem uma proteína. Uso um computador IBM pentium 4 com
> > Windows XP Home. Não sei o que há de errado, alguém pode me ajudar a
> > resolver este problema?
> >
> > Obrigado,
> > Alexandre
> >
> >
> > ________________________________
> > Discover the new Windows Vista Learn more!
> > ________________________________
> > Novos endereços, o Yahoo! que você conhece. Crie um email novo com a sua
> > cara @ymail.com ou @rocketmail.com.
> > ________________________________
> > Get news, entertainment and everything you care about at Live.com. Check
> it
> > out!
> > _______________________________________________
> > SaoPaulo-pm mailing list
> > SaoPaulo-pm em pm.org
> > http://mail.pm.org/mailman/listinfo/saopaulo-pm
> >
> _______________________________________________
> SaoPaulo-pm mailing list
> SaoPaulo-pm em pm.org
> http://mail.pm.org/mailman/listinfo/saopaulo-pm
>
-------------- Pr?xima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://mail.pm.org/pipermail/saopaulo-pm/attachments/20080722/6ea312dc/attachment.html>