<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:HelveticaNeue, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif;font-size:10pt"><div><span>Oi Aureliano,</span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><br><span></span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span>para filtrar flat files do UniprotKB e do Genbank eu criei meus próprios scripts, usando programação estruturada (há uns bons anos), pois não conseguia me entender bem com o BioPerl e a orientação a objetos.</span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida
Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Também tenho scripts para trabalhar saídas de alinhamentos e do hmmer.<br></span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Como posso ajudar? Que formato estás usando?</span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><br><span></span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Abs,</span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica
Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span>Nicole<br></span></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-size: 13.3333px; font-family: HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif; background-color: transparent; font-style: normal;"><span><br><br></span></div><div style="display: block;" class="yahoo_quoted"> <div style="font-family: HelveticaNeue, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif; font-size: 10pt;"> <div style="font-family: HelveticaNeue, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif; font-size: 12pt;"> <div dir="ltr"> <font face="Arial" size="2"> Em Terça-feira, 6 de Maio de 2014 19:35, Aureliano Guedes <guedes_1000@hotmail.com> escreveu:<br> </font> </div> <div class="y_msg_container"><div id="yiv7659536864"><style>#yiv7659536864 #yiv7659536864 -- .yiv7659536864EmailQuote
{margin-left:1pt;padding-left:4pt;border-left:#800000 2px solid;}#yiv7659536864 </style><div>
<div class="yiv7659536864PlainText">O projeto nao e paralelo ao BioPerl, e dentro do BioPerl. Eu observei que ele e muito rico em ferramentas complexas para diversas áreas da bioinfo mas carece um pouco de ferramentas para filtrar os dados obtidos. Ou quando se tem um ferramenta
para isso pesquisar ela e difícil também. Então eu vou montar um grupo de ferramentas para filtrar dados.<br clear="none">
Já eu subo pro CPAN um primeiro para tirar como exemplo.<br clear="none">
<br clear="none">
Andre Carneiro <andregarciacarneiro@gmail.com> escreveu:<br clear="none">
<br clear="none">
</div>
<div class="yiv7659536864yqt0664778520" id="yiv7659536864yqt02415"><div>
<div dir="ltr">Não sei exatamente o que você quer fazer. Só queria dizer que existe o Bioperl. Não sei se você conhece.
<div><br clear="none">
</div>
<div><a rel="nofollow" shape="rect" target="_blank" href="http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page">http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page</a><br clear="none">
</div>
<div><br clear="none">
</div>
<div><br clear="none">
</div>
</div>
<div class="yiv7659536864x_gmail_extra"><br clear="none">
<br clear="none">
<div class="yiv7659536864x_gmail_quote">2014-05-06 16:22 GMT-03:00 Felipe da Veiga Leprevost <span dir="ltr">
<<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:felipe@leprevost.com.br" target="_blank" href="mailto:felipe@leprevost.com.br">felipe@leprevost.com.br</a>></span>:<br clear="none">
<blockquote class="yiv7659536864x_gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div dir="ltr">
<div class="yiv7659536864x_gmail_default" style="font-family:courier new, monospace;">Olá Aureliano,</div>
<div class="yiv7659536864x_gmail_default" style="font-family:courier new, monospace;"><br clear="none">
</div>
<div class="yiv7659536864x_gmail_default" style="font-family:courier new, monospace;">Desculpa mas eu não entendi a proposta do seu módulo, pode explicar um pouco melhor dando exemplos?</div>
<div class="yiv7659536864x_gmail_default" style="font-family:courier new, monospace;">abraços</div>
</div>
<div class="yiv7659536864x_gmail_extra"><br clear="none">
<br clear="none">
<div class="yiv7659536864x_gmail_quote">2014-05-06 15:25 GMT-03:00 Tiago Peczenyj <span dir="ltr">
<<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:tiago.peczenyj@gmail.com" target="_blank" href="mailto:tiago.peczenyj@gmail.com">tiago.peczenyj@gmail.com</a>></span>:
<div>
<div class="yiv7659536864x_h5"><br clear="none">
<blockquote class="yiv7659536864x_gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div dir="ltr">Bota logo no cpan. Como versão beta </div>
<div class="yiv7659536864x_gmail_quote">Em 06/05/2014 15:20, "Aureliano Guedes" <<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:guedes_1000@hotmail.com" target="_blank" href="mailto:guedes_1000@hotmail.com">guedes_1000@hotmail.com</a>> escreveu:<br clear="none">
<blockquote class="yiv7659536864x_gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div>
<div>
<div>
<div dir="ltr">Ola monges,
<div><br clear="none">
</div>
<div>Quero convidar todos nossos amigos que trabalham com bioinformática aderentes da filosofia open source a se juntar a mim para o desenvolvimento de um conjunto de módulos direcionados para filtra as longas listas de informações que temos que lidar na bioinformática. </div>
<div><br clear="none">
</div>
<div>A ideia é ter fácil acesso por meio de pesquisa simples e direcionada a ferramentas para filtrar dados na bioinformática.</div>
<div><br clear="none">
</div>
<div>Iniciei o projeto, e já tenho algumas ferramentas que vou revisar e fazer testes para incluir no projeto para enviar em breve para nosso querido CPAN.</div>
<div><br clear="none">
</div>
<div>Quem quiser e puder colaborar, ficarei grato.</div>
<div><br clear="none">
</div>
<div>GitHub: <a rel="nofollow" shape="rect" target="_blank" href="https://github.com/acpguedes/Bio--Filter.git" style="font-size:12pt;">https://github.com/acpguedes/Bio--Filter.git</a></div>
<div>contato: <a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:guedes.aureliano@gmail.com" target="_blank" href="mailto:guedes.aureliano@gmail.com">guedes.aureliano@gmail.com</a></div>
<div><br clear="none">
</div>
<div>Estou aberto a critica, sugestões, colaborações, etc.</div>
<div><br clear="none">
</div>
<div>Abraços,</div>
<div><br clear="none">
</div>
<div>Aureliano Guedes</div>
</div>
</div>
<br clear="none">
</div>
</div>
_______________________________________________<br clear="none">
Rio-pm mailing list<br clear="none">
<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:Rio-pm@pm.org" target="_blank" href="mailto:Rio-pm@pm.org">Rio-pm@pm.org</a><br clear="none">
<a rel="nofollow" shape="rect" target="_blank" href="http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm">http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm</a><br clear="none">
</blockquote>
</div>
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_______________________________________________<br clear="none">
Rio-pm mailing list<br clear="none">
<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:Rio-pm@pm.org" target="_blank" href="mailto:Rio-pm@pm.org">Rio-pm@pm.org</a><br clear="none">
<a rel="nofollow" shape="rect" target="_blank" href="http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm">http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm</a><br clear="none">
</blockquote>
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<span class="yiv7659536864x_HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="none">
<br clear="all">
</font></span><div><br clear="none">
</div>
-- <br clear="none">
<div dir="ltr"><span style="font-family:courier new, monospace;">Felipe da Veiga Leprevost, PhD</span>
<div><span style="font-family:courier new, monospace;"><a rel="nofollow" shape="rect" target="_blank" href="http://www.leprevost.com.br/">www.leprevost.com.br</a><br clear="none">
</span>
<div><span style="font-family:courier new, monospace;">Laboratory for Proteomics and Protein Engineering.</span></div>
<div><span style="font-family:courier new, monospace;">Fiocruz, Brazil.</span></div>
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_______________________________________________<br clear="none">
Rio-pm mailing list<br clear="none">
<a rel="nofollow" shape="rect" ymailto="mailto:Rio-pm@pm.org" target="_blank" href="mailto:Rio-pm@pm.org">Rio-pm@pm.org</a><br clear="none">
<a rel="nofollow" shape="rect" target="_blank" href="http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm">http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm</a><br clear="none">
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-- <br clear="none">
André Garcia Carneiro<br clear="none">
Software Engineer<br clear="none">
(11)982907780 </div>
</div></div>
</div></div><br><div class="yqt0664778520" id="yqt22805">_______________________________________________<br clear="none">Rio-pm mailing list<br clear="none"><a shape="rect" ymailto="mailto:Rio-pm@pm.org" href="mailto:Rio-pm@pm.org">Rio-pm@pm.org</a><br clear="none"><a shape="rect" href="http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm" target="_blank">http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm</a></div><br><div class="yqt0664778520" id="yqt03117">_______________________________________________<br clear="none">Rio-pm mailing list<br clear="none"><a shape="rect" ymailto="mailto:Rio-pm@pm.org" href="mailto:Rio-pm@pm.org">Rio-pm@pm.org</a><br clear="none"><a shape="rect" href="http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm" target="_blank">http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm</a></div><br><br></div> </div> </div> </div> </div></body></html>