[Rio-pm] Configuração de usuário não root no cpan & Perl Roll em Rocks Cluster
Stanislaw Pusep
creaktive em gmail.com
Quinta Janeiro 30 01:14:05 PST 2014
Olá Nicole!
Já passei por situação semelhante à sua, quando não podia atualizar o Perl
default do sistema e a opção foi instalar um Perl mais atualizado avulso no
/usr/local. Para sempre usar o Perl do /usr/local, 3 medidas foram tomadas:
1. export PATH=/usr/local/bin:$PATH
2. Os shebangs de todos os scripts executáveis do projeto foram modificados
de:
#!/usr/bin/perl
para:
#!/usr/bin/env perl
3. local::lib foi utilizado para CPAN "desovar" no $HOME. O local::lib
requer uma intervenção do .profile do sistema, para inicializar o
environment apropriadamente. Seguem os passos para instalar o local::lib
dessa forma.
3.1. Download do local::lib:
$ wget
http://cpan.metacpan.org/authors/id/H/HA/HAARG/local-lib-2.000004.tar.gz
$ tar xzvf local-lib-2.000004.tar.gz
$ cd local-lib-2.000004/
3.2. Instalação do local::lib:
$ perl Makefile.PL --bootstrap=$HOME/perl5
$ make
$ make test
$ make install
3.3. Ativando local::lib na inicialização da shell (Bash):
$ cat << PROFILE >> $HOME/.profile
eval \$(perl -I\$HOME/perl5/lib/perl5/ -Mlocal::lib)
PROFILE
$
A idéia aqui é que rodar "perl -I$HOME/perl5/lib/perl5/ -Mlocal::lib"
retorna para STDOUT as tais das variáveis de ambiente que fazem o Perl
buscar instalação dos módulos em um lugar específico ($HOME). Pode
simplesmente colar essas variáveis direto no .profile, ou (como demonstrado
acima) rodar eval do output do Perl.
3.4. Carregar a configuração:
. $HOME/.profile
3.5. Prosseguindo com a configuração/teste do CPAN e do cpanm (essa
configuração faz as dependências serem instaladas automaticamente):
$ cpan
cpan[1]> o conf prerequisites_policy follow
cpan[2]> o conf commit
cpan[3]> install App::cpanminus
cpan[4]> quit
Boa sorte!
2014-01-29 Nicole Scherer <bionica2007-perl em yahoo.com>
> Boa tarde, queridos Mongers,
>
> eu não queria importuná-los com problemas simples, mas após três dias
> batendo a cabeça e vasculhando fóruns na internet sem solução para algumas
> das perguntas, recorro a vocês. Vou tentar explicar a novela.
>
> Montamos um cluster HPC para pesquisa usando o Rocks 6.1 (
> http://www.rocksclusters.org/) -- um tipo de linux que instala outro
> linux em todos os nós do cluster e gerencia tudo isso. Novidade pra mim,
> mas funciona. Esse Rocks instala os chamados Rolls, entre eles o próprio SO
> (neste caso o RHEL6) e outros Rolls úteis, como SGE, Ganglia, Web-Server,
> Bio, Perl (4.14.2) entre outros. Estes Rolls são instalados em /opt/ e as
> vezes coexistem com os binários do SO. Desta forma, tenho duas versões de
> Perl:
>
> - a do sistema (RHEL6):
> $ /usr/bin/perl -v
> This is perl, v5.10.1 (*) built for x86_64-linux-thread-multi
>
> - e a do Rocks:
> $ /opt/perl/bin/perl -v
> This is perl 5, version 14, subversion 2 (v5.14.2) built for
> x86_64-linux-thread-multi
>
> Cada qual com as suas bibliotecas.
>
> @INC:
> /usr/local/lib64/perl5
> /usr/local/share/perl5
> /usr/lib64/perl5/vendor_perl
> /usr/share/perl5/vendor_perl
> /usr/lib64/perl5
> /usr/share/perl5
> .
> @INC:
> /opt/perl/lib/site_perl/5.14.2/x86_64-linux-thread-multi
> /opt/perl/lib/site_perl/5.14.2
> /opt/perl/lib/5.14.2/x86_64-linux-thread-multi
> /opt/perl/lib/5.14.2
> .
>
>
> Agora é que começam meus problemas...
>
> Primeiro: Alguém já teve experiência com duas instalações coexistentes de
> Perl? Posso ter problemas de funcionamento no SO se eu mover o
> /usr/bin/perl e criar um link do /opt/perl/bin/perl para /usr/bin/perl
> (uma vez que as shebang dos scripts costuma ter este endereço). Colocar
> simplesmente /opt/perl/bin no início do $PATH pode não ser a solução.
>
>
> O CPAN só está instalado na versão do Rocks, o que me motiva mais a
> deixá-lo como default.
> Como a maioria dos usuários não terão privilégios de root e além disso,
> qualquer instalação no sistema operacional tem que ser espelhada para todos
> os nós, a melhor opção para instalar pacotes é na home dos usuários,
> concordam? Então eu quero deixar tudo o mais fácil possível para que os
> usuários instalem os pacotes desejados. Como não teremos acesso direto à
> internet usei o minicpan para criar um mirror em uma pasta compartilhada
> com minha máquina local. Configurei o urllist do cpan pra ela e ficou tudo
> ok.
> Agora esbarrei em um problema que não estou achando resposta fácil.
>
> Quando executo o cpan pela primeira vez como usuário comum, da forma mais
> automática possível, ele cria, como esperado o arquivo MyConfig.pm e toda a
> estrutura de diretórios no home do usuário. Ele executa quase tudo com
> perfeição, substituindo o endereço default pelo do usuário em QUASE todos
> os itens, menos em prefs_dir.
>
> [hpcst06 em crab ~]$ grep cpan .cpan/CPAN/MyConfig.pm
> 'build_dir' => q[/home/hpcst06/.cpan/build],
> 'cpan_home' => q[/home/hpcst06/.cpan],
> 'histfile' => q[/home/hpcst06/.cpan/histfile],
> 'keep_source_where' => q[/home/hpcst06/.cpan/sources],
> 'prefs_dir' => q[/export/cpan/cpan/prefs],
>
>
> (O default cpan_home é /export/cpan/cpan )
> [hpcst06 em crab ~]$ grep cpan /opt/perl/lib/5.14.2/CPAN/Config.pm
> 'build_dir' => q[/export/cpan/cpan/build],
> 'cpan_home' => q[/export/cpan/cpan],
> 'histfile' => q[/export/cpan/cpan/histfile],
> 'keep_source_where' => q[/export/cpan/cpan/sources],
> 'prefs_dir' => q[/export/cpan/cpan/prefs],
>
>
> Claro que o usuário pode executar
> >o conf prefs_dir /home/hpcst06/.cpan/prefs
> para alterar esta variável, mas concordam que deveria ter sido automático.
> Alguém já passou por isto?
>
> Procurei o erro em FirstTime.pm, mas não consegui localizar algo que me
> chamasse a atenção.
> Exatamente igual ao que tenho no Ubuntu, e que funciona normalmente.
>
>
> - Tendo corrigido manualmente o prefs_dir, segui tentando instalar
> localmente algum pacote.
> Aí eu admito uma grande falta de conhecimento da minha parte, mas tentei
> entender o que os tutoriais na internet e fiquei perdida. Devo usar direto
> o cpan? (já que na configuração ele me pergunta se eu quero que use
> local::lib)
> What approach do you want? (Choose 'local::lib', 'sudo' or 'manual')
> [local::lib]
> Ou devo usar sempre
> $ perl -MCPAN -Mlocal::lib -e 'CPAN::install(Acme::Time::Baby)'
> ?
> (tudo bem, posso colocar esta linha no tutorial, vai assustar os usuários,
> mas funciona)
>
>
> - Rodando
> [hpcst06 em crab ~]$ perl -MCPAN -Mlocal::lib -e
> 'CPAN::install(Acme::Time::Baby)'
>
> - deu tudo certo.
> [...]
> Result: PASS
> ABIGAIL/Acme-Time-Baby-2010090301.tar.gz
> /usr/bin/make test -- OK
> Running make install
> Prepending
> /home/hpcst06/.cpan/build/Acme-Time-Baby-2010090301-wJGXda/blib/arch
> /home/hpcst06/.cpan/build/Acme-Time-Baby-2010090301-wJGXda/blib/lib to
> PERL5LIB for 'install'
> Installing /home/hpcst06/perl5/lib/perl5/Acme/Time/Baby.pm
> Installing /home/hpcst06/perl5/man/man3/Acme::Time::Baby.3
> Appending installation info to
> /home/hpcst06/perl5/lib/perl5/x86_64-linux-thread-multi/perllocal.pod
> ABIGAIL/Acme-Time-Baby-2010090301.tar.gz
> /usr/bin/make install -- OK
>
>
> - Agora, tentei instalar o Data::Printer (Oi Breno!) pela mesma estratégia
> e não consegui. Pode ser que não tenha a ver com a estratégia.
>
> Test Summary Report
> -------------------
> t/05-obj.t (Wstat: 512 Tests: 0 Failed: 0)
> Non-zero exit status: 2
> Parse errors: No plan found in TAP output
> t/06-obj2.t (Wstat: 512 Tests: 0 Failed: 0)
> Non-zero exit status: 2
> Parse errors: No plan found in TAP output
> t/07-sort.t (Wstat: 512 Tests: 1 Failed: 0)
> Non-zero exit status: 2
> Parse errors: No plan found in TAP output
> t/25-weak.t (Wstat: 512 Tests: 8 Failed: 0)
> Non-zero exit status: 2
> Parse errors: No plan found in TAP output
> Files=54, Tests=258, 4 wallclock secs ( 0.19 usr 0.09 sys + 2.82 cusr
> 0.40 csys = 3.50 CPU)
> Result: FAIL
> Failed 4/54 test programs. 0/258 subtests failed.
> make: *** [test_dynamic] Error 255
> GARU/Data-Printer-0.35.tar.gz
> /usr/bin/make test -- NOT OK
> //hint// to see the cpan-testers results for installing this module, try:
> reports GARU/Data-Printer-0.35.tar.gz
> Running make install
> make test had returned bad status, won't install without force
>
>
>
> Desculpem a postagem tão longa. Acabei até solucionando algumas outras
> dúvidas enquanto tentava descrevê-las aqui.
>
> Abraços a todos,
> Nicole Scherer
>
>
>
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