[Rio-pm] Perl é genuinamente uma linguagem de script ou híbrida?

[Cleysinho]

Oi Daniel,

Eu acredito que existem pessoas e pessoas. Eu participei de curso de
inverno de Bioinformática em Ribeirão Preto, senti que eles são
extremamente sérios com estas questões e são um dos maiores incentivadores
de estudantes de graduação a entrarem na área. O belo trabalho in silico é
bem ajustado com os trabalhos de bancada. Resumindo eles são sérios com
estas questões.

Por outro lado veja o programa Phred, Phrap eles são extremamente usados na
bioinformática e até hoje eles não liberaram o código fonte, sempre que
precisar você precisa mandar um email para o cara que desenvolveu para ele
liberar o arquivo já compilado, o pior é que estou falando do programa
amais usado. Programas para detectar regiões de microsateliite mais usados
não disponibilizam o código.


Tem outros centro computacionais importantes no Brasil que publicaram um
sistema de anotação de genoma na Bioinformatics e vendem o serviços de
anotação.

É a realidade que vivemos hoje no que se diz computação científica.

2012/2/18 Ole Peter Smith <ole.ufg em gmail.com>

> uma coisa e dados, outro e codigo. Tem que compartilhar e o codigo
> mesmo!!!! Caso nao, como ser conhecimeto livre???
>
> No minimo, os algoritmos de pseudocodigo...
>
> Acho muito bacana esta discussao, que eu vejo em nemhuma outra lista!
>
> 0le
>
> 2012/2/17 Daniel Hughes <dsth em cantab.net>
>
>>
>> Veja bem, isso é polêmico mas... uma vez que vc teve a ideia e vc
>>> implementou isso é "seu". Dependendo do seu grau de instrução no assunto vc
>>> pode querer ter a ideia para si ou dividir com o mundo. Felizmente o mundo
>>> perl gira em torno do CPAN então nós somos incentivados a dividir nossos
>>> codigos com a comunidade mas um cara q cresceu no mundo da biologia, por
>>> exemplo, pode não entender os beneficios disso. Ou seja, querer evitar que
>>> o codigo fonte seja divulgado pode ser um problema cultural onde se
>>> acredita que isso é o certo a se fazer, ou pode ser um desejo expresso do
>>> cara que mesmo compreendendo as inumeras vantagens insiste em ter tudo para
>>> si.
>>>
>>>
>> desculpa, mas fiz meu doutorado em biologia molecular e nao to
>> reconhecendo nada disso. em realidade em biologia tem ainda mais incentivo
>> pra compartilhar dados pq nao pode publicar sem fazer isso. enquanto
>> algumas pessoas talvez demorem um pouco pra assegurar que eles estão os
>> primeiros em geral isso eh em termos de meses no maximo. tanto nos
>> laboratórios quanto em bioinformatica os únicos dados e códigos escondidos
>> sao do setor particular e nao academico.
>>
>>
>> dan.
>>
>>
>> Daniel S. T. Hughes M.Biochem (Hons; Oxford), Ph.D (Cambridge)
>>
>> -------------------------------------------------------------------------------------
>> dsth em cantab.net
>> dsth em cpan.org
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>          The Less I know, the more I want to Look around
>              Diggin' deeper into Higher Ground...  UB40
>                                 .oooO   Oooo.
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>     http://www.mat.ufg.br/docentes/olepeter - ole at mat.ufg.br
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