[Rio-pm] Opinião
André Torres
andretorresrj em gmail.com
Sábado Setembro 3 12:23:54 PDT 2011
Verdade, por isso que vou ter que ler bastante pra entender como essas
coisas funcionam antes de realmente começar a fazer algo.
2011/9/3 Daniel Hughes <dsth em cantab.net>
> pipelines sao usados o tempo todo em bioinformatica e podem ser sistemas
> bem complicados que geram os processo intermediarios si mesmos. mas em
> realidade a coisa mais importante eh a colecao de regras de
> inter-dependencia entre as varias etapas. por este fato nunca sub-estime o
> velho 'make'. pode ser utilisados pra prejotos bem complicados.
>
> dan.
>
>
> Daniel S. T. Hughes M.Biochem (Hons; Oxford), Ph.D (Cambridge)
> European Bioinformatics Institute
>
> -------------------------------------------------------------------------------------
> dsth em ebi.ac.uk
> dsth em cantab.net
>
>
>
> 2011/9/3 André Torres <andretorresrj em gmail.com>
>
>> Eu acho que é exatamente isso que eu preciso. um pipeline.
>> eu preciso fazer com que a informação que cada software devolve seja
>> avaliada por outro e que no final me devolva uma coisa arrumada. enfim, vou
>> ter que estudar bastante isso antes de começar.
>>
>> aceito mais ideias se alguem tiver.
>>
>> valeu galera, vcs ajudaram bastante dando um rumo pra começar a pesquisar.
>> abração.
>>
>> Em 2 de setembro de 2011 15:15, Eden Cardim <edencardim em gmail.com>escreveu:
>>
>> >>>>> "André" == André Torres <andretorresrj em gmail.com> writes:
>>>
>>> André> dou o input para o primeiro software e recebo o output o
>>> André> output do primeiro vai ser aberto no segundo software que por
>>> André> sua vez vai me dar outro output. haveria a possbilidade de
>>> André> fazer o segundo software entender que os outputs do primeiro
>>> André> ja estariam prontos para serem abertos por ele e
>>> André> "analisados"?
>>>
>>> Isso se chama "pipeline", o mundo unix costuma abreviar para "pipe". Se
>>> você estiver num unix, isso já tá implementado pra você
>>> genericamente. Se você quiser algo mais específico e programático, tem
>>> protocolos/softwares para gestão de filas como o AMPQ.
>>>
>>> --
>>> Eden Cardim
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>>> Shadowcat Systems Ltd. Want a managed development or deployment
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>>> http://www.shadowcat.co.uk/servers/
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>> "Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja
>> animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante."
>> (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952)
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"Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal
ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante." (Albert
Schweitzer - Nobel da Paz de 1952)
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