<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=us-ascii">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 11 (filtered medium)">
<!--[if !mso]>
<style>
v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style>
<![endif]-->
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
@font-face
        {font-family:sans-serif;
        panose-1:0 0 0 0 0 0 0 0 0 0;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline;}
tt
        {font-family:"Courier New";}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:Arial;
        color:navy;}
@page Section1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.25in 1.0in 1.25in;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
</style>

</head>

<body lang=EN-US link=blue vlink=purple>

<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'>Is the file tab
delimited? This seems to work:<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'>perl -alnF'\t' -e
'print if ($F[6] == 1)' inputfile.txt<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'>HTH,<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'>j<o:p></o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face="Courier New"><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=2 color=navy face=Arial><span style='font-size:
10.0pt;font-family:Arial;color:navy'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<div>

<div class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><font size=3
face="Times New Roman"><span style='font-size:12.0pt'>

<hr size=2 width="100%" align=center tabindex=-1>

</span></font></div>

<p class=MsoNormal><b><font size=2 face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;
font-family:Tahoma;font-weight:bold'>From:</span></font></b><font size=2
face=Tahoma><span style='font-size:10.0pt;font-family:Tahoma'> Dhundy Kiran
Bastola [mailto:dkbastola@mail.unomaha.edu] <br>
<b><span style='font-weight:bold'>Sent:</span></b> Tuesday, January 12, 2010
5:43 AM<br>
<b><span style='font-weight:bold'>To:</span></b> Jay Hannah<br>
<b><span style='font-weight:bold'>Subject:</span></b> Re: 874</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>

<p class=MsoNormal><font size=3 face="Times New Roman"><span style='font-size:
12.0pt'><br>
</span></font><font size=2 face=sans-serif><span style='font-size:10.0pt;
font-family:sans-serif'>The file has too many rows for xls to open :)</span></font>
<br>
<font size=2 face=sans-serif><span style='font-size:10.0pt;font-family:sans-serif'>How
do I do the following?</span></font> <br>
<br>
<tt><font face="Courier New">I have 7 column in a row</font></tt> <br>
<tt><font face="Courier New">A file has say millions of rows</font></tt> <br>
<tt><font face="Courier New">I would like to do a grep, based on the content of
6th or 7th column.</font></tt> <br>
<tt><font face="Courier New">e.g. say the 7th column has either a 0 or 1</font></tt>
<br>
<tt><font face="Courier New">I would like to grep those rows that has a value
of 1</font></tt> <br>
<font size=2 face=sans-serif><span style='font-size:10.0pt;font-family:sans-serif'>====================================<br>
Dhundy (Kiran) Bastola, Ph.D.<br>
Assistant Professor, Bioinformatics<br>
Department of Computer Science<br>
College of Information Science and Technology<br>
Peter Kiewit Institute # 177D<br>
University of Nebraska, Omaha, NE 68182<br>
<br>
Phone: (402) 554-4899<br>
Fax &nbsp; : &nbsp;(402) 554-3284<br>
email : dkbastola@mail.unomaha.edu</span></font><o:p></o:p></p>

</div>

</body>

</html>