[Moscow.pm] "Perl -- за и против"

[Alessandro Gorohovski]

Grigory V.Sapunov <grigory.sapunov на gmail.com> писал(а) в своём письме Sat,  
01 Sep 2012 16:28:30 +0300:

>>> А ваши сомнения на чём основаны?
>>>
>>
>> Основаны на том, что для расшифровки RNA написано очень много кода на  
>> Perl
>> (не только известный bioperl)
>> и подавляющее большинство иностранных Web-ресурсов (например, NCBI)
>> использует perl-scripts.
>
> С тем количеством проектов, которое есть в ncbi, я думаю, там вообще  
> много всего можно найти :)
>
>> Думаю, выбор perl здесь не случаен --- основан на особенностях языка,
>> оптимизированного
>> для работы с последовательностями символов (RNAseq, proteins, ...)
>>
>
> Это, конечно, да, но хардкорный анализ (типа различных бластов) чаще
> реализуется на чём-то более эффективном, типа C. blast+, например, на
> плюсах.

Согласен. Тут нужна хорошая скорость вычислений.

> Мне кажется, перл здесь больше годится для всякой мелкой работы. Как   
> клей.

А 'R in a nutshell' Вам довелось прочитать?

-- 
ANG