[Curitiba-pm] XML em Perl

[Guilherme Rodrigues Machado]

*Olá, *

Stanislaw, funcionou perfeitamente o XML::Simple.

Por enquanto não tenho problema de consumo de
memória, muito grato pelo aviso Andre.

Obrigado pelo retorno !!!

Grande abraço,
Guilherme.

Em 29 de outubro de 2012 15:33, Andre Carneiro <
andregarciacarneiro at gmail.com> escreveu:

> Cuidado com o XML::Simple!!! Ele 'morde'... memória! Bastante memória! A
> versão 'crua' dele gasta memória proporcionalmente ao tamanho do XML, ou
> seja, quanto maior o XML, mais memória você gastará!
>
> Se puder, codifique utilizando parsers que implementam SAX/SAX2 em
> produção. Eles trabalham com 'eventos'. Para simplificar, não mantém o XML
> todo na memória, como uma implementação 'crua' via XML::Simple. O próprio
> XML::Simple tem suporte a SAX(Embora eu nunca tenha usado...). Então, RTFM
> my friend!
>
>
>
>
>
> Cheers!
>
>
>
>
> On Mon, Oct 29, 2012 at 3:09 PM, Stanislaw Pusep <creaktive at gmail.com>wrote:
>
>> Boa tarde, Guilherme!
>> Seria algo assim:
>>
>> #!/usr/bin/env perl
>> use strict;
>> use warnings 'all';
>> use Data::Dumper;
>> use LWP::Simple;
>> use XML::Simple;
>>
>> my $obj = XMLin(get('
>> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=taxonomy&id=192')
>> );
>> print Dumper $obj->{Taxon}{OtherNames}{Synonym};
>>
>> ABS()
>>
>>
>>
>> On Mon, Oct 29, 2012 at 2:11 PM, Guilherme Rodrigues Machado <
>> guilherme.lrm at gmail.com> wrote:
>>
>>> *Caros, boa tarde.*
>>>
>>> Estou utilizando os seguintes módulos:
>>> - XML::SIMPLE
>>> - LWP::Simple
>>>
>>> Para acessar o seguinte XML
>>> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=taxonomy&id=192
>>>
>>> O retorno é +/- esse:
>>>
>>> $VAR1 = {
>>>>           'Taxon' => {
>>>>                        'CreateDate' => '1995/02/27 09:24:00',
>>>>                        'Division' => 'Bacteria',
>>>>                        'TaxId' => '192',
>>>>                        'MitoGeneticCode' => {
>>>>                                             'MGCId' => '0',
>>>>                                             'MGCName' => 'Unspecified'
>>>>                                           },
>>>>                        'OtherNames' => {
>>>>                                          'Includes' => 'bacterium
>>>> ASAZOES-148',
>>>>                                          'Name' => [
>>>>                                                    {
>>>>                                                      'DispName' =>
>>>> 'Roseomonas fauriae Rihs et al. 1998',
>>>>                                                      'ClassCDE' =>
>>>> 'authority'
>>>>                                                    },
>>>>                                                    {
>>>>                                                      'DispName' =>
>>>> 'strain sp. 7',
>>>>                                                      'ClassCDE' =>
>>>> 'type material'
>>>>                                                    }
>>>>                                                  ],
>>>>                                          'Synonym' => [
>>>>                                                       'Roseomonas
>>>> fauriae',
>>>>                                                       'Azospirillum
>>>> brasiliense',
>>>>                                                       'Spirillum
>>>> lipoferum'
>>>>                                                     ]
>>>>                                        },
>>>>                        'LineageEx' => {
>>>>                                       'Taxon' => [
>>>>                                                  {
>>>>                                                    'TaxId' => '131567',
>>>>                                                    'Rank' => 'no rank',
>>>>                                                    'ScientificName' =>
>>>> 'cellular organisms'
>>>>                                                  },
>>>>                                                  {
>>>>                                                    'TaxId' => '191',
>>>>                                                    'Rank' => 'genus',
>>>>                                                    'ScientificName' =>
>>>> 'Azospirillum'
>>>>                                                  }
>>>>                                                ]
>>>>                                     },
>>>>                        'Lineage' => 'cellular organisms; Bacteria;
>>>> Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales; Rhodospirillaceae;
>>>> Azospirillum',
>>>>                        'Rank' => 'species',
>>>>                        'GeneticCode' => {
>>>>                                         'GCName' => 'Bacterial,
>>>> Archaeal and Plant Plastid',
>>>>                                         'GCId' => '11'
>>>>                                       },
>>>>                        'PubDate' => '1993/04/26 01:00:00',
>>>>                        'ScientificName' => 'Azospirillum brasilense',
>>>>                        'UpdateDate' => '2012/10/24 17:17:04',
>>>>                        'ParentTaxId' => '191'
>>>>                      }
>>>>         };
>>>>
>>>
>>>
>>> Saberia dizer como eu acesso os 3 conteúdos do vetor 'SYNONYM' ?
>>>
>>> Muito obrigado.
>>>
>>> Grande abraço,
>>> Guilherme Machado
>>> UFPR - Mestrando em Bioinformática
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> André Garcia Carneiro
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