[Curitiba-pm] XML em Perl

[Andre Carneiro]

Cuidado com o XML::Simple!!! Ele 'morde'... memória! Bastante memória! A
versão 'crua' dele gasta memória proporcionalmente ao tamanho do XML, ou
seja, quanto maior o XML, mais memória você gastará!

Se puder, codifique utilizando parsers que implementam SAX/SAX2 em
produção. Eles trabalham com 'eventos'. Para simplificar, não mantém o XML
todo na memória, como uma implementação 'crua' via XML::Simple. O próprio
XML::Simple tem suporte a SAX(Embora eu nunca tenha usado...). Então, RTFM
my friend!





Cheers!




On Mon, Oct 29, 2012 at 3:09 PM, Stanislaw Pusep <creaktive at gmail.com>wrote:

> Boa tarde, Guilherme!
> Seria algo assim:
>
> #!/usr/bin/env perl
> use strict;
> use warnings 'all';
> use Data::Dumper;
> use LWP::Simple;
> use XML::Simple;
>
> my $obj = XMLin(get('
> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=taxonomy&id=192')
> );
> print Dumper $obj->{Taxon}{OtherNames}{Synonym};
>
> ABS()
>
>
>
> On Mon, Oct 29, 2012 at 2:11 PM, Guilherme Rodrigues Machado <
> guilherme.lrm at gmail.com> wrote:
>
>> *Caros, boa tarde.*
>>
>> Estou utilizando os seguintes módulos:
>> - XML::SIMPLE
>> - LWP::Simple
>>
>> Para acessar o seguinte XML
>> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=taxonomy&id=192
>>
>> O retorno é +/- esse:
>>
>> $VAR1 = {
>>>           'Taxon' => {
>>>                        'CreateDate' => '1995/02/27 09:24:00',
>>>                        'Division' => 'Bacteria',
>>>                        'TaxId' => '192',
>>>                        'MitoGeneticCode' => {
>>>                                             'MGCId' => '0',
>>>                                             'MGCName' => 'Unspecified'
>>>                                           },
>>>                        'OtherNames' => {
>>>                                          'Includes' => 'bacterium
>>> ASAZOES-148',
>>>                                          'Name' => [
>>>                                                    {
>>>                                                      'DispName' =>
>>> 'Roseomonas fauriae Rihs et al. 1998',
>>>                                                      'ClassCDE' =>
>>> 'authority'
>>>                                                    },
>>>                                                    {
>>>                                                      'DispName' =>
>>> 'strain sp. 7',
>>>                                                      'ClassCDE' => 'type
>>> material'
>>>                                                    }
>>>                                                  ],
>>>                                          'Synonym' => [
>>>                                                       'Roseomonas
>>> fauriae',
>>>                                                       'Azospirillum
>>> brasiliense',
>>>                                                       'Spirillum
>>> lipoferum'
>>>                                                     ]
>>>                                        },
>>>                        'LineageEx' => {
>>>                                       'Taxon' => [
>>>                                                  {
>>>                                                    'TaxId' => '131567',
>>>                                                    'Rank' => 'no rank',
>>>                                                    'ScientificName' =>
>>> 'cellular organisms'
>>>                                                  },
>>>                                                  {
>>>                                                    'TaxId' => '191',
>>>                                                    'Rank' => 'genus',
>>>                                                    'ScientificName' =>
>>> 'Azospirillum'
>>>                                                  }
>>>                                                ]
>>>                                     },
>>>                        'Lineage' => 'cellular organisms; Bacteria;
>>> Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales; Rhodospirillaceae;
>>> Azospirillum',
>>>                        'Rank' => 'species',
>>>                        'GeneticCode' => {
>>>                                         'GCName' => 'Bacterial, Archaeal
>>> and Plant Plastid',
>>>                                         'GCId' => '11'
>>>                                       },
>>>                        'PubDate' => '1993/04/26 01:00:00',
>>>                        'ScientificName' => 'Azospirillum brasilense',
>>>                        'UpdateDate' => '2012/10/24 17:17:04',
>>>                        'ParentTaxId' => '191'
>>>                      }
>>>         };
>>>
>>
>>
>> Saberia dizer como eu acesso os 3 conteúdos do vetor 'SYNONYM' ?
>>
>> Muito obrigado.
>>
>> Grande abraço,
>> Guilherme Machado
>> UFPR - Mestrando em Bioinformática
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André Garcia Carneiro
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