[Cascavel-pm] retirando dados de texto pra bd mysql...
Gabriel Rodrigues
gabrielrodrigues06 em yahoo.com.br
Terça Abril 13 12:43:42 CDT 2004
Olá pessoal blz ?
Tenho um arquivo com essas características...
>gnl|uv|J01749.1:1-4361-49 Cloning vector pBR322
TTCTCATGTTTGACAGCTTATCATCGATAAGCTTTAATGCGGTAGTTTATCACAGTTAAATTGCTAACGC
AGTCAGGCACCGTGTATGAAATCTAACAATGCGCTCATCGTCATCCTCGGCACCGTCACCCTGGATGCTG
TAGGCATAGGCTTGGTTATGCCGGTACTGCCGGGCCTCTTGCGGGATATCGTCCATTCCGACAGCATCGC
>gnl|uv|X66730.1:1-2687-49 B.bronchiseptica plasmid
pBBR1 genes for mobilization and replication
CTCGGGCCGTCTCTTGGGCTTGATCGGCCTTCTTGCGCATCTCACGCGCTCCTGCGGCGGCCTGTAGGGC
AGGCTCATACCCCTGCCGAACCGCTTTTGTCAGCCGGTCGGCCACGGCTTCCGGCGTCTCAACGCGCTTT
GAGATTCCCAGCTTTTCGGCCAATCCCTGCGGTGCATAGGCGCGTGGCTCGACCGCTTGCGGGCTGATGG
.
.
.
gostaria de pegar antes de tudo o codigo que estah
depois do segundo pipe '|' ateh o primeiro espaço que
vier, mandando o mesmo para uma coluna no mysql...
depois pegar o que estiver depois do espaco e mandar
para um outro campo no bd mysql...
Depois disso pegar estah mesma linha que inicia com
'>' INTEIRA e enviar para uma outra coluna.
Em seguida tem que enviar todo o codigo que vem com as
letras ACGT para um unico campo tipo binario. São
todas as letras ateh a proxima entrada que começar com
outro '>' que aí já não faz mais parte da sequencia
antiga...
obrigado
Gabriel Rodrigues
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